自动化学院的前身为自动控制系，成立于1960年，相关专业最早于1953年开设，是全国高校最早成立自动控制专业的学校之一，已经历了半个多世纪的发展历程。自动控制系成立初期，其教学和科研主要服务于军事，以火炮和雷达等军工产品为研究对象，形成了指挥仪、随动系统和大系统专业。设有随动系统、液压传动和陀螺仪等研究方向，其中指挥仪专业是中国计算机科学研究的发源地之一，后来发展为计算机应用专业，这也是北京理工大学计算机学院的前身。1977年恢复高考制度后，专业调整为三个本科专业，分别是自动控制理论、工业自动化和流体传动与控制。1998年根据教育部学科专业调整要求，三个本科专业合并为自动化专业，2002年又申请新增了电气工程及自动化专业。
　　学院最早于1978年开始在自动控制理论及应用、工业自动化、惯性导航、电气传动与控制、流体传动与控制五个学科方向招收硕士研究生，1984年建立自动控制理论学科博士点并开始招收博士研究生，1996年建立导航、制导与控制学科博士点，1998年建立博士后流动站，1999年获批一级学科博士点。学院2006年建立电气工程硕士点并开始招收硕士研究生，1997年为企业培养控制工程硕士，2009年在控制招收专业学位研究生，2012年开始招收工程博士。
　　学院有控制科学与工程一级学科博士授权点，所包含的学科方向分别是控制理论与控制工程、导航制导与控制、模式识别与智能系统、智能信息处理与控制、检测技术与自动化装置、电气工程与控制。其中控制理论与控制工程学科为国家级重点学科，导航、制导与控制学科为国家重点培育学科，模式识别与智能系统学科为原国防科工委重点学科。控制科学与工程一级学科为北京市一级重点学科，2017年，入选教育部“双一流”建设学科名单，第四轮教育部学科评估评为A类学科。
　　学院拥有“复杂系统智能控制与决策”国家重点实验室和教育部重点实验室、“自动控制系统”北京市重点实验室、“导航、制导与控制”教育部工程中心、“自动化实验中心”工信部实验教学示范中心和北京市实验教学示范中心、“伺服运动系统驱动与控制”工信部重点实验室。同时，共建仿人机器人与系统教育部重点实验室、机器人与系统教育部国际联合实验室、无人车技术工信部重点实验室、电工电子国家级实验教学示范中心和武器系统虚拟仿真国家级实验教学示范中心。
　　学院现有专职教师123人，其中其中正高26人，副高61人，讲师36人。教师队伍中有中国工程院院士２人、长江学者3人、杰青2人、外专千人1人、国家“万人计划”领军人才1人、国家级百千万人才2人、科技部中青年领军人才1人、优青2人、青年拔尖人才2人、青年长江1人、青千2人、新世纪优秀人才10人、国防科技工业有突出贡献中青年专家1人、北京市教学名师4人、青年托举计划3人。现有国家基金委创新研究群体1个、教育部长江学者创新团队3个、国防科技创新团队1个，工信部研究型创新教学团队1个。
　　学院现有“自动化”和“电气工程及其自动化”两个本科专业，其中自动化专业2010年获批教育部特色专业，2014年通过中国工程教育认证(有效期6年)，电气工程及自动化专业2011年被教育部批准实施“卓越工程师计划”，2012年建立自动化全英文授课专业。
　　学院每年招收本科生约240名（其中自动化专业180名，电气工程及自动化专业60名）、硕士研究生190余名、博士研究生近45名、学位留学生30名左右。近年来，获全国挑战杯特等奖1项、一等奖4项，学生参加各种科技创新活动的人数超过60%以上，六年五次荣获学校“世纪杯”大学生科技竞赛团体第1名，获北京市优博1篇，全国一级学会优博4篇，提名2篇。
　　近二十年学院培养的学生中，有院士、国家千人计划、长江学者、杰青、美国工程院院士、国外著名高校首席或终身教授、“985”、“211”高校校领导、院长、教授、中央军委部门领导、高级将领、政府机关厅局级领导、军工企业董事长、总经理等优秀人才。
　　学院与美国、日本、英国、澳大利亚、德国、加拿大等国家的十几所大学、研究机构和企业进行了多方面交流，在人才培养、科学研究、学术交流等方面进行了卓有成效的友好合作。
　　学院以第一完成人和完成单位获国家科技奖7项（包括国家自然科学二等奖1项）、省部级奖19项；近五年，承担国家自然科学基金50多项（包括重点、重大、仪器专项和国际合作、杰青、优青等），作为首席获批“973”项目2项；国家重点研发计划1项；承担“973”、“863”课题9项，承担总装预研、重点型号和科技合作200余项。年均科研经费超过1.5亿元。发表学术论文年均约200余篇，其中SCI收录年均100余篇，ESI高被引论文11篇，近五年，出版专著、教材15部，包括英文专著4部。
　　近五年，学院有20多个科研成果实现了转化，服务于国防现代化和国民经济社会发展，并参加国庆60周年阅兵、9.3阅兵和建军90周年阅兵，产生了巨大的军事和经济效益。在庆祝建国60周年阅兵的30个地面武器方阵中本学科参与了9个。在庆祝中国抗日战争胜利70周年“9.3”阅兵中，获“装备保障先进单位”荣誉称号。
近年来，学院承担了学校“211工程”、“985工程”和“推进行动”等重点学科建设项目，控制科学与工程学科也成为学校重点建设的8个第一梯次学科，科研环境与条件得到明显改善，为学科持续稳定发展奠定了良好基础。
　　经过六十多年的建设发展，学院在军用与民用深度融合、基础理论与应用研究等方面具有明显的特色与优势，未来将面向国家重大需求和国际学术前沿开展研究，坚持科教促进融合，加强国际交流合作，将本学科建设成具有鲜明特色的高水平拔尖创新人才培养和科学研究的重要基地。为我国国民经济发展和国防建设做出了应有的贡献。